Der Grund für die einmalige Färbung des Sees ist untersucht und letztendlich nicht geklärt worden. Man nimmt jedoch an, dass die
Nährstoffkonzentration aus verschiedenen organischen und anorganischen Stoffen, sowie verschiedene Bakterien und Algen im See, die Verursacher dieser einmaligen Rosa-Verfärbung sind. Die Farbe dieses Wasser verändert sich auch dann nicht, wenn es entnommen und in ein Gefäß gegeben wird.
Einmalig ist am Lake Hillier, dass er die Pinkfarben dauerhaft zeigt, während es einzelne andere Salzseen gibt, die nur unter bestimmten Wetterbedingungen und Lichtverhältnisse diese seltene Wasserfärbung zeigen.